写点什么

在 GCP 搭建使用 NVIDIA GPU 做机器学习的 K8S 集群

  • 2021-03-24
  • 本文字数:1665 字

    阅读完需:约 5 分钟

在 GCP 搭建使用 NVIDIA GPU 做机器学习的 K8S 集群

本文介绍如何使用 NVIDIA 官方推荐工具和 K8S 插件,在谷歌云 GCP 的虚机上搭建用于机器学习任务的带显卡 K8S 集群。

 

另外,也介绍了如何更新 K8S 插件,来解决当带显卡 Node 维护重启时,由于 GPU ID 发生变化而导致训练任务无法继续的问题。该问题的描述可以参考在线记录。注意,该问题在使用各公有云虚机时都可能发生,触发原因是虚机维护重启后,从一台宿主机迁移到另一台宿主机,所配置的显卡实例也随之改变,显卡 ID 变化,而 NVIDIA K8S 插件在 0.9.0 版本之前不能容忍这个变化,而导致上层 Tensorflow 等应用无法在重启后获取到显卡。此问题在谷歌云 GKE 环境中不会发生,因为谷歌云 GKE 使用的是定制版插件。

 

本文搭建一个包含一台 Master 和一台 Node 的 K8S 集群,其中 Node 上配置一块 NVIDIA T4 显卡。之后复现显卡 ID 问题,并介绍升级环境解决问题的步骤。

创建虚机实例

 

在谷歌云控制台创建以下配置的虚机。注意确认使用的项目和区域有充足的 CPU 和 GPU quota。

●      一台 Master 节点

○      k8s-m

○      n1-standard-1

○      Ubuntu LTS 16.04

 

●      一台 Node 节点

○      k8s-t4-node

○      n1-standard-1

○      Ubuntu LTS 16.04

○      T4 GPU

创建完后确认 master 和 node 都运行正常。

搭建 K8S 集群

 

参考 NVIDIA 官方文档

https://docs.nvidia.com/datacenter/cloud-native/kubernetes/install-k8s.html#option-1-installing-kubernetes-using-deepops

以及 DeepOps 文档

https://github.com/NVIDIA/deepops/tree/master/docs/k8s-cluster

首先,登录到 k8s-m,执行以下命令安装 Ansible 工具

下载并初始化 DeepOps 脚本

创建 SSH 密钥对,并将公钥配置为 Node 的允许密钥。注意要将私钥配置为其它用户不可访问。

参照下面截图更改 Ansible 配置文件,指定 K8S 的 master 和 node 信息,以及密钥对信息



验证 Ansible 配置


启动 Ansible 来安装 K8S 集群

安装完成后,用下面命令来验证集群运行正常


在 gpu01 节点上运行以下命令确认容器环境可以识别到显卡。

注意:Image 版本需要参考官方文档

至此,K8S 集群安装完毕。现在可以部署机器学习训练或预测任务在此集群。

复现节点重启后 GPU Device ID 变化问题

 

在刚搭建好的 K8S 集群 master 上查看 NVIDIA K8S Plugin 的版本




根据输出,此集群上使用的 NVIDIA K8S 插件为 0.7.0 版本。此版本会产生重启后显卡 Device ID 变化而找不到显卡的问题。

 

查看当前显卡 Device ID 。

 



用下面命令用序号查看显卡设备。

 


安装并运行测试程序容器 nvidia-loop 。其功能是持续占用显卡并不断打印 GPU Device ID 。

 


查看 nvidia-loop 的日志

 


以上命令都应该成功无错。到此都不会出现任何问题。

 

使用以下命令模拟 GCP 虚机维护事件。

 


命令完成后 1 小时,节点会进行重启( 1 小时延迟因为需要完成一个重启前一小时的通知消息)。重启后 node 虚机应该会迁移到另一台宿主机并配置不同 ID 的显卡。此时可以登录到 Node 来查看 GPU Device ID。

 


也可以使用 cuda 镜像来测试在容器内获取 GPU Device ID,也一样发生了变化

可以看到 Device ID 发生了变化。

 

此时查看 nvidia-loop 容器的状态,由于 Device UUID 发生了变化,导致不断 crash。

 


查看 pod 描述,可以看到具体错误为 UUID 变化。

 


修复节点重启后 GPU Device ID 变化问题

 

下面步骤验证 NVIDIA K8S Plugin release 0.9.0 修复了节点重启后 Device ID 变化的问题。

 

首先安装 NVIDIA K8S Plugin 的 0.9.0 版本,并删除之前版本。

 


确认安装成功

 


更新 Node 上 nvidia-runtime 的配置文件,允许 volume mount (否则测试容器 nvidia-loop 会运行失败)。

现在 K8S 插件更新完毕。可以验证问题修复。

 

再次使用以下命令模拟 GCP 虚机维护事件。



等一小时后维护重启完成后,查看 nvidia-loop 容器状态,应该是 Running,而不会再因为维护重启而导致崩溃。

 


也可以查看 nvidia-loop 的日志,确保输出 ID 正常。

 

kubectl logs nvidia-loop --tail=5

参考文档

 

[1] Using the GPU id instead of uuid in the NVIDIA device plugin

2021-03-24 17:452201

评论

发布
暂无评论
发现更多内容

(转)前端开发之MySQL分区表中的性能BUG

@零度

MySQL 前端

盘点2021 | 技术十年-记录十年技术经历

高性能架构探索

技术人 工作经历 经历分享 盘点2021

web技术分享| 白板SDK的几种图形检测算法

anyRTC开发者

前端 音视频 白板 web技术分享 图形检测算法

化繁为简--百度智能小程序主数据架构实战总结

百度Geek说

小程序 百度 架构 后端 数据

10 个打造 React.js App 的最佳 UI 框架

编程江湖

前端开发

(转)大数据开发之Hive中UDTF函数

@零度

大数据 hive

30个类手写Spring核心原理之动态数据源切换(8)

Tom弹架构

Java spring 源码

视频通信中的码率控制算法

拍乐云Pano

音视频 RTC 视频编码 码率控制

Linux之more命令

入门小站

Linux

在线JSON转Csharp工具

入门小站

工具

2021数据技术嘉年华 | OceanBase 技术盛宴ON LINE ,我们不见不散!

OceanBase 数据库

数据库 OceanBase 社区版 技术嘉年华 DTC

6000 字干货详解:直播聊天室的无限用户优化

融云 RongCloud

高并发 直播 直播聊天室 海量用户

熟悉又陌生的白帽黑客组织OWASP

喀拉峻

黑客 网络安全 安全 OWASP

Ajax+SSM实现客户端开发 实现简单的前后端分离

Bug终结者

Java ajax 前后端分离

DotNet工具箱之性能监控组件——CLRStats

为自己带盐

dotnet 28天写作 12月日更

「猿桌派」即将开播,聚焦客户端埋点和大数据分析

融云 RongCloud

大数据 程序员 埋点

【等保小知识】等保一级需要测评吗?

行云管家

网络安全 等保 等级保护 等保一级

孩子,你为什么要上学?

Tiger

28天写作

【MongoDB学习笔记】-使用 MongoDB 进行 CRUD 操作(上)

恒生LIGHT云社区

数据库 mongodb

Linux云计算好学吗?Linux云计算运维学习资料,手把手教你学 条件测试语句和流程控制语句的使用

学神来啦

Linux centos Shell if linux云计算

升级过log4j,却还没搞懂log4j漏洞的本质?

华为云开发者联盟

Java log4j 漏洞 JNDI rmi

给弟弟的信第19封|年轻人要注意养生

大菠萝

28天写作

30个类手写Spring核心原理之自定义ORM(下)(7)

Tom弹架构

Java spring 源码

从Hadoop框架讨论大数据生态

编程江湖

大数据 hadoop

JAVA 开发常用工具汇总

编程江湖

java编程

Apache APISIX 社区双周报 | 功能亮点更新进行中

API7.ai 技术团队

云原生 后端 开源社区 api 网关 Apache APISIX

酷炫3D效果在瘦设备上也能实现?|HDC2021技术分论坛

HarmonyOS开发者

HarmonyOS

从 Discord 看未来社交的「超级群」模式

融云 RongCloud

实用机器学习笔记二十:偏差和方差

打工人!

机器学习 深度学习 算法 学习笔记 12月日更

在 GCP 搭建使用 NVIDIA GPU 做机器学习的 K8S 集群_语言 & 开发_于有志_InfoQ精选文章